Fakultet tehničkih nauka

Predmet: Analiza podataka u genomici (17.BMIM8)

Matične organizacione jedinice predmeta:
Osnovne informacije:
 
Kategorija Stručno-aplikativni
Uža naučna oblast Automatika i upravljanje sistemima
Multidisciplinarna Ne
ESPB 6
Cilj:

Ovladavanje teorijskim i praktičnim osnovama metoda računarske analize podataka dobijenih iz genoma, sa ciljem izvođenja biološki značajnih zaključaka. Biće ukazano na prednosti i mane ovih metoda i na značajne parametre koji utiču na rezultate ovih analiza.

Ishod:

Studenti će razumeti principe dizajna algoritama za obradu bioloških podataka i kako oni rade. Biće sposobni da analiziraju probleme i primene odgovarajuće metode.

Sadržaj:

Poređenje sekvenci. Skriven Markovljev model. Algoritmi za višestruko poravnanje. Analiza ekspresija gena. Populaciona genomika. Molekularna evolucija. Komparativna genomika.

Metodologija izvođenja nastave:

Predavanja, računske vežbe, računarske vežbe, konsultacije

Literatura:
Autori Naziv Godina Izdavač Jezik
R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison Biological Sequence Analysis 1998 Cambridge University Engleski
N. Jones, P. Pevzner An Introduction to Bioinformatics Algorithms 2004 MIT Press Engleski
Formiranje ocene:
Predmetna aktivnost Predispitna Obavezna Broj poena
Predmetni projekat Da Da 70.00
Usmeni deo ispita Ne Da 30.00
Izvođači nastave:

prof. dr Ilić Vojin

Redovni profesor

Predavanja
Računarske vežbe