U spomen Mihajla Pupina, stipendiste i dobrotvora Matice srpske, ustanovljena je nagrada za završne radove studenata do 35 godina starosti, koji predstavljaju doprinos tehničkim i prirodnomatematičkim disciplinama kojima se on bavio, pod imenom PUPINOVA NAGRADA MATICE SRPSKE. Nagrada se dodeljuje od 1996. godine u intervalu od tri godine iz Fonda